Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC23Q9UJX2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC23Q9UJX2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms