Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFD9

RIMBP3, RIMS-binding protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3Q9UFD9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RIMBP3Q9UFD9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RIMBP3Q9UFD9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RIMBP3Q9UFD9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RIMBP3Q9UFD9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RIMBP3Q9UFD9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RIMBP3Q9UFD9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RIMBP3Q9UFD9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RIMBP3Q9UFD9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RIMBP3Q9UFD9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RIMBP3Q9UFD9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms