Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM10Q9UDY6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms