Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRP2BPQ9P2M1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms