Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COA4Q9NYJ1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COA4Q9NYJ1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COA4Q9NYJ1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COA4Q9NYJ1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COA4Q9NYJ1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COA4Q9NYJ1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COA4Q9NYJ1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COA4Q9NYJ1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COA4Q9NYJ1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COA4Q9NYJ1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms