Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.167e-7■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 UBA2-209ENST00000592841 344 ntTSL 22.47□□□□□ -2.017e-7■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.597e-7■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.497e-7■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 AGAP3-209ENST00000469901 582 ntTSL 324.21■■□□□ 1.477e-7■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.167e-7■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 AGAP3-221ENST00000490097 604 ntTSL 418.32■□□□□ 0.527e-7■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.037e-7■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.067e-7■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 GOLPH3-202ENST00000503610 1074 ntTSL 339.2■■■■□ 3.872e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 COX4I1-212ENST00000566617 572 ntTSL 434.38■■■■□ 3.096e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.816e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 UBE2J2-207ENST00000435198 1056 ntTSL 332.21■■■□□ 2.751e-9■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 UBE2K-207ENST00000513231 871 ntTSL 1 (best)29.29■■■□□ 2.286e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.226e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 UBE2J2-210ENST00000464036 1256 ntTSL 328.63■■■□□ 2.171e-9■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 SH2B1-209ENST00000563674 719 ntTSL 328.01■■■□□ 2.076e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 GOLPH3-203ENST00000512668 665 ntTSL 328■■■□□ 2.072e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.016e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 SH2B1-212ENST00000567536 484 ntTSL 327.25■■□□□ 1.956e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 KSR1-211ENST00000580163 479 ntTSL 327.16■■□□□ 1.942e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.852e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.821e-9■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 UBE2J2-209ENST00000461142 837 ntTSL 326.39■■□□□ 1.821e-9■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 UBE2J2-214ENST00000473215 1028 ntTSL 326.07■■□□□ 1.761e-9■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.746e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 INTS11-223ENST00000498173 1589 ntTSL 225.89■■□□□ 1.732e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 UBE2J2-206ENST00000422076 643 ntTSL 525.68■■□□□ 1.71e-9■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 UBE2J2-219ENST00000503294 814 ntTSL 425.68■■□□□ 1.71e-9■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 RPL8-203ENST00000525232 1007 ntTSL 1 (best)25.66■■□□□ 1.72e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.662e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 RER1-201ENST00000306256 695 ntTSL 525.16■■□□□ 1.629e-8■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 UBE2K-206ENST00000510934 589 ntTSL 224.72■■□□□ 1.556e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 COX4I1-205ENST00000563774 566 ntTSL 424.56■■□□□ 1.526e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.516e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.496e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 COX4I1-214ENST00000567266 546 ntTSL 424.34■■□□□ 1.496e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.479e-8■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.436e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 INTS11-220ENST00000493534 896 ntTSL 323.8■■□□□ 1.42e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 ABHD17A-206ENST00000592757 740 ntTSL 323.5■■□□□ 1.356e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 UBE2J2-220ENST00000509720 472 ntTSL 323.29■■□□□ 1.321e-9■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 UBE2J2-211ENST00000466752 886 ntTSL 323.08■■□□□ 1.291e-9■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 UBE2J2-217ENST00000491779 611 ntTSL 223.08■■□□□ 1.291e-9■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.286e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 UBE2J2-216ENST00000488418 750 ntTSL 222.88■■□□□ 1.251e-9■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 SRSF2-201ENST00000358156 572 ntTSL 422.87■■□□□ 1.252e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 INTS11-224ENST00000498476 554 ntTSL 422.87■■□□□ 1.252e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 INTS11-239ENST00000531019 549 ntTSL 422.87■■□□□ 1.252e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 INTS11-219ENST00000490853 704 ntTSL 322.81■■□□□ 1.242e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.212e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 INTS11-215ENST00000470679 584 ntTSL 522.59■■□□□ 1.212e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 COX4I1-213ENST00000567241 561 ntTSL 422.44■■□□□ 1.186e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.186e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.156e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.12e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.091e-9■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 UBE2K-202ENST00000438068 2262 ntTSL 221.67■■□□□ 1.066e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.037e-7■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.032e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 SRSF2-207ENST00000583836 561 ntTSL 521.3■■□□□ 12e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.971e-9■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 INTS11-221ENST00000496353 2428 ntTSL 221.1■□□□□ 0.972e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 ATXN2L-223ENST00000568266 1294 ntTSL 521■□□□□ 0.956e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.932e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.99e-8■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 RPL10-217ENST00000492572 1656 ntTSL 520.69■□□□□ 0.94e-10■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.896e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 RER1-208ENST00000493207 686 ntTSL 220.42■□□□□ 0.869e-8■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.796e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 UBE2J2-218ENST00000502382 530 ntTSL 419.75■□□□□ 0.751e-9■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.746e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 COX4I1-215ENST00000568339 2271 ntTSL 219.51■□□□□ 0.716e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 SRSF2-204ENST00000452355 1357 ntTSL 519.43■□□□□ 0.72e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 UBE2J2-215ENST00000477894 767 ntTSL 519.4■□□□□ 0.71e-9■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 RPL8-210ENST00000531767 570 ntTSL 519.04■□□□□ 0.642e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.616e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 RPL8-212ENST00000532702 745 ntTSL 218.8■□□□□ 0.62e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.552e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 COX4I1-210ENST00000566115 471 ntTSL 318.47■□□□□ 0.556e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.547e-7■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.56e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 INTS11-226ENST00000525285 579 ntTSL 417.99■□□□□ 0.472e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 ACTB-213ENST00000493945 1236 ntTSL 517.9■□□□□ 0.465e-22■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 INTS11-227ENST00000525603 738 ntTSL 317.72■□□□□ 0.432e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 COX4I1-209ENST00000565078 566 ntTSL 417.7■□□□□ 0.426e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 SRSF2-208ENST00000585202 1359 ntTSL 317.66■□□□□ 0.422e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.419e-8■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.46e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.349e-8■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.316e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 COX4I1-206ENST00000564544 617 ntTSL 316.63■□□□□ 0.256e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.253e-7■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 INTS11-244ENST00000532952 773 ntTSL 316.58■□□□□ 0.242e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 COX4I1-218ENST00000570123 551 ntTSL 516.33■□□□□ 0.26e-6■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 RPL10-210ENST00000458500 585 ntTSL 1 (best)16.27■□□□□ 0.24e-10■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.197e-7■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.194e-10■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 RPL10-212ENST00000479366 569 ntTSL 416.25■□□□□ 0.194e-10■□□□□ 9.1
AATFQ9NY61 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.182e-6■□□□□ 9.1
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