Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCM9Q9NXL9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCM9Q9NXL9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms