Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms