Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
COMMD8Q9NX08 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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