Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 MARF1-205ENST00000548025 5891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.676e-7■■■■■ 29.8
RBM22Q9NW64 MARF1-214ENST00000552553 5053 ntTSL 510.2□□□□□ -0.786e-7■■■■■ 29.8
RBM22Q9NW64 MARF1-202ENST00000540441 7105 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.866e-7■■■■■ 29.8
RBM22Q9NW64 MARF1-211ENST00000551742 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.956e-7■■■■■ 29.8
RBM22Q9NW64 MARF1-201ENST00000396368 7743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.096e-7■■■■■ 29.8
RBM22Q9NW64 TRA2B-216ENST00000493864 567 ntTSL 26.63□□□□□ -1.356e-7■■■■■ 29.8
RBM22Q9NW64 TRA2B-211ENST00000477939 530 ntTSL 25.47□□□□□ -1.536e-7■■■■■ 29.8
RBM22Q9NW64 ARHGAP11B-204ENST00000564902 1161 ntTSL 1 (best)4.8□□□□□ -1.646e-7■■■■■ 29.8
RBM22Q9NW64 ARHGAP11B-205ENST00000566362 589 ntTSL 32.12□□□□□ -2.076e-7■■■■■ 29.8
RBM22Q9NW64 HNRNPH1-205ENST00000502632 1509 ntTSL 215.36■□□□□ 0.051e-7■■■■■ 29.8
RBM22Q9NW64 HNRNPH1-206ENST00000502904 2913 ntTSL 29.31□□□□□ -0.921e-7■■■■■ 29.8
RBM22Q9NW64 HNRNPH1-227ENST00000515481 5564 ntTSL 26.03□□□□□ -1.441e-7■■■■■ 29.8
RBM22Q9NW64 USP15-214ENST00000549415 703 ntTSL 36.02□□□□□ -1.455e-7■■■■■ 29.7
RBM22Q9NW64 PIK3CB-204ENST00000462898 4747 ntTSL 517.51■□□□□ 0.395e-7■■■■■ 29.7
RBM22Q9NW64 PSMC2-201ENST00000292644 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.025e-7■■■■■ 29.7
RBM22Q9NW64 PSMC2-206ENST00000640277 1357 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.035e-7■■■■■ 29.7
RBM22Q9NW64 PSMC2-203ENST00000435765 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.135e-7■■■■■ 29.7
RBM22Q9NW64 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.225e-7■■■■■ 29.7
RBM22Q9NW64 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.295e-7■■■■■ 29.7
RBM22Q9NW64 PIK3CB-209ENST00000481749 2396 ntTSL 25.37□□□□□ -1.555e-7■■■■■ 29.7
RBM22Q9NW64 PIK3CB-206ENST00000469284 3164 ntTSL 55.13□□□□□ -1.595e-7■■■■■ 29.7
RBM22Q9NW64 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.655e-7■■■■■ 29.7
RBM22Q9NW64 PDCD6IP-209ENST00000473593 540 ntTSL 24.4□□□□□ -1.715e-7■■■■■ 29.7
RBM22Q9NW64 PIK3CB-213ENST00000493568 2347 ntTSL 24.38□□□□□ -1.715e-7■■■■■ 29.7
RBM22Q9NW64 PSMC2-205ENST00000460021 733 ntTSL 23.66□□□□□ -1.825e-7■■■■■ 29.7
RBM22Q9NW64 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.192e-17■■■■■ 29.7
RBM22Q9NW64 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.678e-8■■■■■ 29.7
RBM22Q9NW64 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.288e-8■■■■■ 29.7
RBM22Q9NW64 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.158e-8■■■■■ 29.7
RBM22Q9NW64 FADS2-204ENST00000517312 588 ntTSL 513.64□□□□□ -0.238e-8■■■■■ 29.7
RBM22Q9NW64 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.288e-8■■■■■ 29.7
RBM22Q9NW64 FADS2-206ENST00000518606 510 ntTSL 47.32□□□□□ -1.248e-8■■■■■ 29.7
RBM22Q9NW64 ATXN2L-223ENST00000568266 1294 ntTSL 517.32■□□□□ 0.369e-7■■■■■ 29.7
RBM22Q9NW64 RNF213-207ENST00000559070 4644 ntTSL 1 (best)11.6□□□□□ -0.554e-8■■■■■ 29.7
RBM22Q9NW64 LIMK2-206ENST00000462625 1042 ntTSL 223.34■■□□□ 1.332e-8■■■■■ 29.7
RBM22Q9NW64 LIMK2-205ENST00000425203 606 ntTSL 1 (best)14.83□□□□□ -0.042e-8■■■■■ 29.7
RBM22Q9NW64 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.875e-7■■■■■ 29.7
RBM22Q9NW64 ARHGEF10L-207ENST00000482359 604 ntTSL 515.87■□□□□ 0.132e-22■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.052e-8■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.13e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 SS18-204ENST00000539244 977 ntTSL 1 (best)13.42□□□□□ -0.263e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.292e-8■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 SS18-202ENST00000269138 1548 ntTSL 212.93□□□□□ -0.343e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 SS18-225ENST00000585121 1545 ntTSL 212.42□□□□□ -0.423e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 EIF3K-213ENST00000593149 760 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.52e-8■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 SS18-213ENST00000579640 1840 ntTSL 210.94□□□□□ -0.663e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 EIF3K-214ENST00000614624 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.682e-8■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 EIF3K-208ENST00000588934 501 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.82e-8■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 SS18-205ENST00000542420 2321 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.813e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 SS18-203ENST00000415083 3414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.823e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 EIF3K-201ENST00000248342 864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.882e-8■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 EIF3K-211ENST00000592558 670 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.882e-8■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 EIF3K-209ENST00000590134 711 ntTSL 28.48□□□□□ -1.052e-8■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 SETD5-225ENST00000488236 1320 ntTSL 57.68□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 RPL13-209ENST00000491523 698 ntTSL 322.86■■□□□ 1.256e-11■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 RPL13-208ENST00000487034 615 ntTSL 1 (best)22.45■■□□□ 1.186e-11■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.976e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.956e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 WARS-207ENST00000553524 707 ntTSL 320.31■□□□□ 0.846e-7■■■■■ 29.6
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RBM22Q9NW64 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.766e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 GIPR-203ENST00000585889 1414 ntTSL 1 (best)19.41■□□□□ 0.76e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 YWHAZ-208ENST00000418997 996 ntTSL 219.39■□□□□ 0.696e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 YWHAZ-210ENST00000437293 701 ntTSL 319.27■□□□□ 0.686e-7■■■■■ 29.6
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RBM22Q9NW64 AC079781.5-203ENST00000641315 2059 nt18.85■□□□□ 0.616e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 ASNS-211ENST00000451771 562 ntTSL 218.83■□□□□ 0.66e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 AC079781.5-201ENST00000641390 3211 nt18.41■□□□□ 0.543e-12■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 WARS-209ENST00000553581 572 ntTSL 418.34■□□□□ 0.536e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 TBCD-207ENST00000571796 1940 ntTSL 1 (best)18.2■□□□□ 0.52e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.486e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 TNIP1-207ENST00000520695 658 ntTSL 418■□□□□ 0.476e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 TBCD-204ENST00000571316 1509 ntTSL 1 (best)17.77■□□□□ 0.443e-8■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.436e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.436e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.46e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 WARS-212ENST00000553934 530 ntTSL 317.52■□□□□ 0.46e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 WARS-239ENST00000557239 471 ntTSL 417.17■□□□□ 0.346e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 WARS-236ENST00000556783 567 ntTSL 517.12■□□□□ 0.336e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.316e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.36e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 RPL13-205ENST00000467736 528 ntTSL 316.82■□□□□ 0.286e-11■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 IL18BP-203ENST00000343898 1720 ntTSL 1 (best)16.75■□□□□ 0.276e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 WARS-206ENST00000553413 568 ntTSL 516.5■□□□□ 0.236e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.216e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 GIPR-204ENST00000588816 709 ntTSL 516.32■□□□□ 0.26e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.176e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.176e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.166e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.136e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 TNIP1-206ENST00000519339 1815 ntTSL 1 (best)15.61■□□□□ 0.096e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.057e-8■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 ASNS-212ENST00000453600 573 ntTSL 314.97□□□□□ -0.016e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.036e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.096e-7■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 TBCD-225ENST00000576996 827 ntTSL 514.29□□□□□ -0.123e-8■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 RPL13-213ENST00000565571 568 ntTSL 214.15□□□□□ -0.146e-11■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.11□□□□□ -0.153e-12■■■■■ 29.6
RBM22Q9NW64 FUBP3-205ENST00000487406 840 ntTSL 513.91□□□□□ -0.186e-7■■■■■ 29.6
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