Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IMP3Q9NV31 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IMP3Q9NV31 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms