Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMC4Q9NTJ3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMC4Q9NTJ3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms