Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms