Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 TTC3-219ENST00000485402 3626 ntTSL 521.05■□□□□ 0.963e-9■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 TTC3-202ENST00000355666 7712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.23e-9■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 NLGN2-203ENST00000572893 305 ntTSL 337.95■■■■□ 3.675e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 PIGQ-208ENST00000443147 2054 ntTSL 231.94■■■□□ 2.75e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 PIGQ-218ENST00000635909 2212 ntTSL 527.14■■□□□ 1.945e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.75e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 PIGQ-224ENST00000638143 563 ntTSL 524.21■■□□□ 1.475e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.365e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 PIGQ-222ENST00000637468 650 ntTSL 523.5■■□□□ 1.355e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 PIGQ-221ENST00000636657 2841 ntTSL 523.21■■□□□ 1.315e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.275e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 PIGQ-220ENST00000636005 1355 ntTSL 522.78■■□□□ 1.245e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.812e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.672e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 LAS1L-203ENST00000374811 2439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.482e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 LAS1L-205ENST00000484069 5205 ntTSL 215.9■□□□□ 0.142e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.528e-8■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.468e-8■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 ZFAND3-207ENST00000474522 563 ntTSL 58.93□□□□□ -0.988e-8■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 UCKL1-205ENST00000483710 524 ntTSL 315.88■□□□□ 0.132e-7■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.923e-7■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.13e-7■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 ZNF598-206ENST00000564824 2147 ntTSL 538■■■■□ 3.671e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.181e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.731e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 ZNF598-203ENST00000562988 3382 ntTSL 525.66■■□□□ 1.71e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 ZNF598-207ENST00000565396 4457 ntTSL 224.03■■□□□ 1.441e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 KDM4B-206ENST00000588361 3039 ntTSL 221.57■■□□□ 1.042e-6■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 SLC6A8-209ENST00000476466 470 ntTSL 321.75■■□□□ 1.076e-29■■■■□ 21.4
DROSHAQ9NRR4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.858e-10■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 LRRD1-202ENST00000422722 3511 ntTSL 214.26□□□□□ -0.138e-10■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.78e-10■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 CYP51A1-203ENST00000435873 556 ntTSL 44.58□□□□□ -1.688e-10■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 ETV5-203ENST00000421809 554 ntTSL 231.56■■■□□ 2.643e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 ETV5-210ENST00000476890 642 ntTSL 230.34■■■□□ 2.453e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 XRCC3-215ENST00000555964 562 ntTSL 426.75■■□□□ 1.873e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.793e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 XRCC3-204ENST00000553361 746 ntTSL 525.76■■□□□ 1.713e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 XRCC3-218ENST00000557439 2599 ntTSL 525.34■■□□□ 1.653e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.653e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.423e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.353e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.263e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.232e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 XRCC3-203ENST00000553332 560 ntTSL 321.93■■□□□ 1.13e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.023e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 XRCC3-212ENST00000555231 582 ntTSL 320.98■□□□□ 0.953e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 ETV5-204ENST00000422039 564 ntTSL 420.42■□□□□ 0.863e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 AGPAT3-208ENST00000448287 454 ntTSL 318.55■□□□□ 0.566e-7■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 ETV5-201ENST00000306376 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.543e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 DGKG-205ENST00000447054 295 ntTSL 318.33■□□□□ 0.533e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.432e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 XRCC3-216ENST00000556682 535 ntTSL 416.49■□□□□ 0.233e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 BOK-202ENST00000641230 183 nt15.34■□□□□ 0.053e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.043e-7■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 ETV5-202ENST00000413301 573 ntTSL 410.9□□□□□ -0.663e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 ETV5-207ENST00000440773 574 ntTSL 49.45□□□□□ -0.93e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -13e-7■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.463e-7■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 CD63-203ENST00000546457 607 ntTSL 221.34■■□□□ 1.012e-10■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.815e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.715e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.685e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 AC002116.2-201ENST00000586962 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.224e-8■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 HAX1-210ENST00000531435 1284 ntTSL 215.42■□□□□ 0.065e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.345e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 PQLC1-212ENST00000590895 865 ntTSL 326.5■■□□□ 1.831e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC24.67■■□□□ 1.541e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 VEGFA-216ENST00000512683 475 ntTSL 1 (best)19.74■□□□□ 0.751e-6■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 SH3D21-203ENST00000480549 3182 ntTSL 224.87■■□□□ 1.571e-8■■■■□ 21.3
DROSHAQ9NRR4 CARS-204ENST00000439280 1021 ntTSL 327.82■■■□□ 2.041e-6■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.371e-6■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 CARS-207ENST00000465331 583 ntTSL 321.38■■□□□ 1.011e-6■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 CARS-213ENST00000527330 564 ntTSL 420.15■□□□□ 0.821e-6■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 CARS-211ENST00000524825 550 ntTSL 420.15■□□□□ 0.821e-6■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.791e-6■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 CARS-216ENST00000639317 135 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.611e-6■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 CARS-202ENST00000380525 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.481e-6■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 CARS-201ENST00000278224 2491 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.421e-6■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 CARS-215ENST00000531387 2805 ntTSL 215.33■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 CARS-212ENST00000526890 5732 ntTSL 213.28□□□□□ -0.281e-6■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.017e-7■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.283e-11■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.343e-11■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 TMC6-220ENST00000591756 475 ntTSL 227.67■■■□□ 2.026e-7■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 TMC6-217ENST00000590934 386 ntTSL 517.63■□□□□ 0.416e-7■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.941e-6■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 R3HDM4-205ENST00000589445 705 ntTSL 334.26■■■■□ 3.081e-6■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 BRD4-201ENST00000263377 7169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.142e-6■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.421e-7■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.361e-7■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 INTS11-235ENST00000527719 750 ntTSL 529.63■■■□□ 2.331e-7■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.311e-7■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.261e-7■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 INTS11-230ENST00000526332 579 ntTSL 429.11■■■□□ 2.251e-7■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.141e-7■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 INTS11-218ENST00000488042 1134 ntTSL 227.4■■□□□ 1.981e-7■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 INTS11-237ENST00000530031 800 ntTSL 526.89■■□□□ 1.91e-7■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 INTS11-207ENST00000434694 1056 ntTSL 526.62■■□□□ 1.851e-7■■■■□ 21.2
DROSHAQ9NRR4 INTS11-232ENST00000526904 551 ntTSL 425.72■■□□□ 1.711e-7■■■■□ 21.2
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