Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH2B1Q9NRF2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms