Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC28A3Q9HAS3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC28A3Q9HAS3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms