Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUS3Q9BZE2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms