Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIFKQ9BYG3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms