Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC46A2Q9BY10 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC46A2Q9BY10 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms