Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
FANCD2Q9BXW9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
FANCD2Q9BXW9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
FANCD2Q9BXW9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
FANCD2Q9BXW9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC35.89■■■■□ 3.34
FANCD2Q9BXW9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
FANCD2Q9BXW9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
FANCD2Q9BXW9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
FANCD2Q9BXW9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
FANCD2Q9BXW9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
FANCD2Q9BXW9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC35.87■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC35.84■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
FANCD2Q9BXW9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms