Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRRTQ9BXP5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRRTQ9BXP5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms