Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL3Q9BXA9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SALL3Q9BXA9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms