Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF4Q9BUZ4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF4Q9BUZ4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF4Q9BUZ4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF4Q9BUZ4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF4Q9BUZ4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF4Q9BUZ4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF4Q9BUZ4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms