Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHANK2-AS3Q9BTD1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms