Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms