Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PMCHL2Q9BQD1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PMCHL2Q9BQD1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms