Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCMTD1Q96MG8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms