Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM227BQ96M60 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms