Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2E2Q96LR5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E2Q96LR5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms