Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A4AQ96JQ5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms