Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LRRIQ1Q96JM4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
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