Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms