Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RNF34Q969K3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF34Q969K3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms