Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP13Q92995 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP13Q92995 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP13Q92995 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP13Q92995 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP13Q92995 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP13Q92995 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP13Q92995 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP13Q92995 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP13Q92995 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP13Q92995 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP13Q92995 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP13Q92995 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP13Q92995 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP13Q92995 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP13Q92995 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP13Q92995 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP13Q92995 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP13Q92995 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP13Q92995 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP13Q92995 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP13Q92995 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP13Q92995 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP13Q92995 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP13Q92995 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP13Q92995 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP13Q92995 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP13Q92995 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP13Q92995 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP13Q92995 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP13Q92995 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP13Q92995 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP13Q92995 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP13Q92995 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP13Q92995 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP13Q92995 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP13Q92995 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP13Q92995 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP13Q92995 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP13Q92995 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP13Q92995 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP13Q92995 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP13Q92995 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP13Q92995 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP13Q92995 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP13Q92995 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP13Q92995 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP13Q92995 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP13Q92995 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP13Q92995 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP13Q92995 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP13Q92995 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP13Q92995 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP13Q92995 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP13Q92995 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP13Q92995 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP13Q92995 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP13Q92995 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP13Q92995 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP13Q92995 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP13Q92995 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP13Q92995 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP13Q92995 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP13Q92995 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP13Q92995 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP13Q92995 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP13Q92995 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP13Q92995 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP13Q92995 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP13Q92995 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP13Q92995 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP13Q92995 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP13Q92995 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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