Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA4DQ92854 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms