Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNRQ92752 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNRQ92752 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNRQ92752 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNRQ92752 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNRQ92752 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNRQ92752 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNRQ92752 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNRQ92752 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TNRQ92752 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TNRQ92752 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TNRQ92752 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TNRQ92752 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TNRQ92752 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TNRQ92752 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TNRQ92752 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNRQ92752 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNRQ92752 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNRQ92752 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNRQ92752 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNRQ92752 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNRQ92752 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNRQ92752 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNRQ92752 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNRQ92752 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNRQ92752 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNRQ92752 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNRQ92752 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNRQ92752 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNRQ92752 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNRQ92752 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TNRQ92752 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TNRQ92752 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNRQ92752 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNRQ92752 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TNRQ92752 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TNRQ92752 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNRQ92752 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNRQ92752 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNRQ92752 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNRQ92752 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNRQ92752 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNRQ92752 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNRQ92752 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNRQ92752 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNRQ92752 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNRQ92752 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNRQ92752 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNRQ92752 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TNRQ92752 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNRQ92752 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNRQ92752 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNRQ92752 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNRQ92752 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNRQ92752 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNRQ92752 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNRQ92752 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNRQ92752 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNRQ92752 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TNRQ92752 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNRQ92752 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNRQ92752 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNRQ92752 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNRQ92752 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNRQ92752 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNRQ92752 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNRQ92752 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNRQ92752 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNRQ92752 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNRQ92752 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNRQ92752 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNRQ92752 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNRQ92752 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNRQ92752 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TNRQ92752 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TNRQ92752 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNRQ92752 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNRQ92752 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNRQ92752 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNRQ92752 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TNRQ92752 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TNRQ92752 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TNRQ92752 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
TNRQ92752 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TNRQ92752 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TNRQ92752 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNRQ92752 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNRQ92752 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNRQ92752 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNRQ92752 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNRQ92752 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNRQ92752 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNRQ92752 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNRQ92752 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNRQ92752 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TNRQ92752 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNRQ92752 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNRQ92752 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNRQ92752 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNRQ92752 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms