Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNAAF4Q8WXU2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNAAF4Q8WXU2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNAAF4Q8WXU2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNAAF4Q8WXU2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNAAF4Q8WXU2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
DNAAF4Q8WXU2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNAAF4Q8WXU2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNAAF4Q8WXU2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNAAF4Q8WXU2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNAAF4Q8WXU2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
DNAAF4Q8WXU2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAAF4Q8WXU2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAAF4Q8WXU2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAAF4Q8WXU2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAAF4Q8WXU2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAAF4Q8WXU2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAAF4Q8WXU2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAAF4Q8WXU2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAAF4Q8WXU2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAAF4Q8WXU2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAAF4Q8WXU2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAAF4Q8WXU2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAAF4Q8WXU2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNAAF4Q8WXU2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms