Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPIRE2Q8WWL2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPIRE2Q8WWL2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms