Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMO7Q8WWI1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMO7Q8WWI1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132 ms