Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC107Q8WV48 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms