Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBASH3BQ8TF42 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
UBASH3BQ8TF42 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
UBASH3BQ8TF42 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3BQ8TF42 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3BQ8TF42 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3BQ8TF42 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3BQ8TF42 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3BQ8TF42 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3BQ8TF42 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3BQ8TF42 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3BQ8TF42 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3BQ8TF42 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3BQ8TF42 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3BQ8TF42 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3BQ8TF42 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3BQ8TF42 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3BQ8TF42 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBASH3BQ8TF42 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms