Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM1

ZNF680, Zinc finger protein 680, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF680Q8NEM1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF680Q8NEM1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF680Q8NEM1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF680Q8NEM1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF680Q8NEM1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF680Q8NEM1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF680Q8NEM1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF680Q8NEM1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF680Q8NEM1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF680Q8NEM1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF680Q8NEM1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF680Q8NEM1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF680Q8NEM1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF680Q8NEM1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms