Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDI1

EHBP1, EH domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1Q8NDI1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EHBP1Q8NDI1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHBP1Q8NDI1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms