Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL34Q8N239 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KLHL34Q8N239 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KLHL34Q8N239 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KLHL34Q8N239 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KLHL34Q8N239 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KLHL34Q8N239 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KLHL34Q8N239 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms