Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMYD4Q8IYR2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms