Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNMB4Q86W47 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms