Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYT9Q86SS6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYT9Q86SS6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms