Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHST3Q7LGC8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHST3Q7LGC8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHST3Q7LGC8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHST3Q7LGC8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHST3Q7LGC8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHST3Q7LGC8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHST3Q7LGC8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHST3Q7LGC8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHST3Q7LGC8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHST3Q7LGC8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHST3Q7LGC8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST3Q7LGC8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms