Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KIAA1549LQ6ZVL6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KIAA1549LQ6ZVL6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms