Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC149Q6ZUS6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC149Q6ZUS6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC149Q6ZUS6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC149Q6ZUS6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC149Q6ZUS6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC149Q6ZUS6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC149Q6ZUS6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC149Q6ZUS6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC149Q6ZUS6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC149Q6ZUS6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC149Q6ZUS6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC149Q6ZUS6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC149Q6ZUS6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC149Q6ZUS6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC149Q6ZUS6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms